PARADIGM

L’antibiorésistance constitue un défi majeur de santé publique, avec des conséquences cliniques et économiques importantes. En 2019, six agents pathogènes dont Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae et Acinetobacter baumannii ont chacun été responsables de plus de 250 000 décès liés à la résistance aux antibiotiques. Cette situation rend urgente l’identification d’alternatives thérapeutiques efficaces.

La phagothérapie, traitement des infections par des bactériophages (phages), des virus ciblant uniquement les bactéries sans infecter les humains ni les animaux, représente une stratégie innovante et prometteuse. La spécificité d’action des phages, qui ciblent une seule espèce bactérienne ou certaines souches seulement, permet de concevoir des traitements personnalisés. Cette précision nécessite toutefois d’identifier rapidement le phage actif contre la bactérie responsable de l’infection. La phagothérapie personnalisée repose donc sur :

• des bio-banques de phages fournissant les matériaux de départ pour la production de médicaments de phagothérapie (PTMP)
• des outils pour sélectionner rapidement les phages les plus efficaces contre la souche ciblée
• des méthodes garantissant la stabilité et la qualité des phages

Le projet PARADIGM vise à développer des outils innovants et à établir un processus opérationnel standardisé au sein d’une infrastructure dédiée, le Phagocenter, qui fournira un accès rapide aux matériaux de départ nécessaires à la production de PTMP ciblant les bactéries multirésistantes à Gram négatif.

Cette initiative réunit des équipes de l’Assistance Publique–Hôpitaux (AP-HP) de Paris, de l’Institut Pasteur, de l’Université Paris Cité, de Sorbonne Université et du Commissariat à l’Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives (CEA). Ensemble, elles développent une filière française de phagothérapie personnalisée contre les pathogènes E. coli, K. pneumoniae et A. baumannii multirésistants.

Les principaux objectifs du projet sont de :

1. Créer une biobanque nationale de phages et de souches bactériennes hôtes
2. Développer des outils numériques (in silico) et optiques pour accélérer l’analyse des phagogrammes
3. Mettre en place des méthodes de contrôle de la stabilité des suspensions de phages
4. Étudier des composés biocompatibles pour prolonger la conservation des PTMP

Le projet PARADIGM contribuera ainsi à :

• structurer une biobanque nationale pour trois agents pathogènes multirésistants prioritaires ;
• transférer rapidement les tests de sensibilité aux phages des laboratoires vers les hôpitaux ;
• établir des standards nationaux et internationaux pour la phagothérapie ;
• renforcer un écosystème français de recherche et d’application clinique en phagothérapie, avec un impact direct sur la santé publique et l’innovation thérapeutique.